بدنبال سفر مقام معظم رهبري به شهر قم در سال 1374 دستور تشكيل استان قم صادر و متعاقب آن در تيرماه سال 1375 سازمان برنامه بودجه استان به عنوان شاخه استاني سازمان برنامه و بودجه كشور تاسيس و آغاز به كار نمود. در سال 1381 بدنبال ادغام سازمان برنامه و بودجه كشور و سازمان امور اداري و استخدامي كشور و تشكيل سازمان مديريت و برنامه‌ريزي  كشور، در استانها نيز سازمان برنامه و بودجه استان و مركز آموزش مديريت دولتي در يكديگر ادغام شده و سازمان مديريت و برنامه‌ريزي  استان شكل گرفت.

در سال 1386 شوراي عالي اداري در يكصد و سي و سومين جلسه خود ، در راستاي تحقق چشم انداز جمهوري اسلامي ايران در افق 1404 و سياست هاي كلي نظام و برنامه چهارم توسعه و به منظور حسن اجراي اصول 60،124 و 126 قانون اساسي جمهوري اسلامي ايران و اجراي مفاد ماده 154 برنامه چهارم توسعه، معاونت نظارت و هماهنگي بر سياست هاي اقتصادي و علمي معاون اول رئيس جمهور ، معاونت هماهنگي و نظارت راهبردي نهاد رياست جمهور ، سازمان مديريت و برنامه ريزي كشور وموسسات وابسته آن ، با تمام وظايف و اختيارات و مسئوليت ها و دارايي و تعهدات و اعتبارات و امكانات و نيروي انساني، ادغام و با عنوان دو معاونت به نام هاي معاونت برنامه ريزي و نظارت راهبردي رئيس جمهور و  معاونت توسعه مديريت و سرمايه انساني رئيس جمهورفعاليت نمايند. دراستانها نيز به تبع آن سازمان مديريت وبرنامه ريزي با استانداري ها ادغام و تحت عنوان معاونت برنامه ريزي استانداري ادامه فعاليت نمايد كه بعدا نام آن به معاونت برنامه ريزي واشتغال تغيير يافت .

در نهايت با دستور رئيس جمهور و تصويب شوراي عالي اداري با ادغام دو معاونت برنامه ريزي و نظارت راهبردي و توسعه مديريت و سرمايه انساني رئيس جمهور، سازمان مديريت و برنامه ريزي كشور احياء گرديد. و به طبع آن سازمان مديريت و برنامه ريزي استانها از استانداريها منتزع و احياء گرديد، در تاريخ ۸ دي ماه سال ۱۳۹۳ رئيس محترم جمهور در اجراي اصل ۱۲۶ قانون اساسي طي حكم جديد محمدباقر نوبخت را به عنوان معاون رئيس جمهور و رئيس سازمان مديريت و برنامه ريزي كشور منصوب كرد.

اين سازمان وظايف ستادي و مهم استان در امور برنامه، بودجه، نيروي انساني، آمار و آموزش و پژوهش دستگاههاي دولتي را بر عهده داشته و به عنوان دبيرخانه شوراي برنامه‌ريزي  و توسعه استان نقش اساسي در تصميم سازي هاي كلان استان ايفا مي نمايد.